地點:中央研究院人文館遠距會議室
時間: 2012/11/16, 9:00-12:00
講員: 中央研究院資訊科學研究所 及資訊創新中心 系統生物與網路生物學實驗室 林仲彥博士 研究團隊
第三章 高通量生物網路解析與實驗室智慧雲端化
Chapter 3. Rewire the biological complex and Digitize your research works
9:00-9:20: 林仲彥 博士 (Chung-Yen Lin Ph.D.)
中央研究院資訊科學研究所與資訊創新中心
系統網路生物實驗室 (http://eln.iis.sinica.edu.tw)
內容:簡介實驗室相關研究、生物資訊系統平台與資料庫等
第一部份: 複雜生物網路的解析 (投影片下載)
Session I: Decipher the essentials and sub-networks from complex biological networks for drug target selection
9: 20 -10:10 金家豪博士 (Dr. Chia-Hao Chin)
中央研究院高明達研究員實驗室
內容: 整合多種拓樸演算法方式來解析複雜生物網路,找出其中關鍵分子或是重要次網路,除了能進一步瞭解其中所代表的生物意義外,也可協助藥物標的的選取。這些平台,目前被多個國際免疫研究團隊用來解析innate immune system 的蛋白質網路,也被應用在感染過程中宿主與病毒之間的交互作用分析,瞭解病毒蛋白所挾持的宿主蛋白複合體的生物功能。除此之外,也能被利用在社會網路與社群網路的分析上。
生物資訊平台:
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Hubba (Nucleic Acids Research, 2008) (影音簡介): Identify hubs from biological network ,
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Cytohubba (影音簡介): Cytoscape plug-in
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Spotlight (Gene, 2012, 影音簡介): Identify protein complex from network
第二部份:電子實驗室記事本
Session II: Digitize your experimental designs and results into wisdom from Discovery to Publication
10:20 - 11:10 黃智偉 先生 (Mr. Tima, Chi-Wei Huang)
中央研究院系統網路生物實驗室
內容:將實驗室中所產生的各種紀錄與大量數據,以電子化方式儲存於網路伺服器/一般桌上型/筆記型電腦,可藉由一般電腦、筆記型電腦與移動式裝置如智慧型手機與平板電腦等,透過一般的網路瀏覽器就可以來存取相關內容與研究數據,以高親和性介面,協助使用者管理、分享、搜尋、備份、列印,及與國內外研究伙伴線上討論相關問題,讓實驗室的眾多智慧、想法與研究歷程得以紀錄回顧與交互串連,不受時空與人員異動的影響,進而激盪出新的成果與方向。此一系統,除可供個人使用外,亦可建置成為一般實驗室內部與對外網站,並可作為國際合作研究平台,目前研究團隊正進行雲端版本的開發,與優化移動式設備(smart phone, ipad etc)的存取介面,讓實驗室的智慧結晶得以快速存取與整合,並隨時上傳新的想法與心得,即時分享給研究伙伴,加速研究的進展。